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　　《恐怖的二楼》少年畑野龙（铃木福 饰）似乎天生具有灵视的能力，他和外婆、妈妈（YOU 饰）搬到新家，结果发现他们不是这里的唯一住户。小龙看见了女鬼，可是妈妈却不相信；《X医院》信心受挫的实习医生佐佐木直树（藤谷太辅 饰）倍感压力，在此期间，各种诡异事件也交替在他身边出现，令他疲于奔命；《影子的暗示》厌倦了枯燥的工作，远山美和（深田恭子 饰）计划转职旅游公司，期间她时常会看见神秘黑影，而黑影所至之处必然发生灾难；《女子高中大危机》在女子高中任教的泽木洋介（坂口宪二 饰），其班上名叫亚里沙的女孩似乎制作了一个地下网站，他没有料到，恐怖的危机正慢慢降临这所高中；《蠕动的人偶》园田里菜（指原莉乃 饰）在街上相中了一个士兵人偶，于是不假思索将其买了下来，谁知这个仿佛有生命的玩偶正渐渐影响她的生活。

　　不知曾几何时，地球突然爆发恐怖的丧尸病毒，成千上万的人被病毒感染，随后化作嗜血丧尸撕咬同类，正常人类的数字直线减少。帕特里克（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）和杰克（杰弗里·多诺万 Jeffrey Donovan 饰）当年乘坐巴士疏散，谁知途中遭遇最惨烈的 事件，这两个男人以及一个尚在襁褓中的小婴儿成为唯一的幸存者。九年后，地球上人类所剩无几，杰克以及当年的婴儿——可爱的小女孩露（奎恩·麦克科甘 Quinn McColgan 饰）住在一个寒冷的山村，父女俩相亲相爱，甜蜜温馨。与之相对，胡子拉碴的帕特里克与他们比邻而居，他似乎与杰克有着深深的隔膜。　　某个飘雪的夜晚，露意外在院落外目击到久未出现的丧尸的行踪，曾经的噩梦再度浮现……

 以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。

　　横跨30年的10宗灭门惨案，所有遇害家庭都有一个共通点：有一位14号生日的小女生。